MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Microcystis aeruginosa NIES-843 chromosome

Total Repeats: 115696

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010296	CAA	2	6	8	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166362742
2	NC_010296	CTT	2	6	14	19	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166362742
3	NC_010296	GAT	2	6	37	42	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166362742
4	NC_010296	A	6	6	66	71	100 %	0 %	0 %	0 %	166362742
5	NC_010296	TCG	2	6	74	79	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166362742
6	NC_010296	GCG	2	6	100	105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	166362742
7	NC_010296	GCA	2	6	106	111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166362742
8	NC_010296	GGT	2	6	130	135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166362742
9	NC_010296	GTT	2	6	159	164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166362742
10	NC_010296	TCG	2	6	210	215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166362742
11	NC_010296	GAT	2	6	234	239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166362742
12	NC_010296	ATG	3	9	260	268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166362742
13	NC_010296	GCG	2	6	288	293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	166362742
14	NC_010296	TTTTC	2	10	351	360	0 %	80 %	0 %	20 %	166362742
15	NC_010296	A	6	6	506	511	100 %	0 %	0 %	0 %	166362742
16	NC_010296	TAC	2	6	514	519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166362742
17	NC_010296	CTT	2	6	527	532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166362742
18	NC_010296	ATC	2	6	590	595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166362742
19	NC_010296	TA	3	6	599	604	50 %	50 %	0 %	0 %	166362742
20	NC_010296	TCG	2	6	638	643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166362742
21	NC_010296	CCGCTC	2	12	722	733	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	166362742
22	NC_010296	GGA	2	6	744	749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166362742
23	NC_010296	TA	3	6	757	762	50 %	50 %	0 %	0 %	166362742
24	NC_010296	AGGA	2	8	791	798	50 %	0 %	50 %	0 %	166362742
25	NC_010296	CTT	2	6	908	913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166362742
26	NC_010296	TAG	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166362742
27	NC_010296	TTA	2	6	966	971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166362742
28	NC_010296	AAT	2	6	975	980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166362743
29	NC_010296	TAA	3	9	1014	1022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166362743
30	NC_010296	AGTT	2	8	1094	1101	25 %	50 %	25 %	0 %	166362743
31	NC_010296	T	6	6	1100	1105	0 %	100 %	0 %	0 %	166362743
32	NC_010296	ATT	2	6	1111	1116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166362743
33	NC_010296	ACT	2	6	1138	1143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166362743
34	NC_010296	AATA	2	8	1153	1160	75 %	25 %	0 %	0 %	166362743
35	NC_010296	GAG	2	6	1171	1176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166362743
36	NC_010296	ATA	2	6	1188	1193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166362743
37	NC_010296	ACC	2	6	1200	1205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	166362743
38	NC_010296	ACC	2	6	1253	1258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	166362743
39	NC_010296	GAA	2	6	1268	1273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166362743
40	NC_010296	TCC	2	6	1374	1379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166362743
41	NC_010296	TAA	2	6	1461	1466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166362743
42	NC_010296	AAG	2	6	1550	1555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010296	CAAG	2	8	1704	1711	50 %	0 %	25 %	25 %	166362744
44	NC_010296	ACG	2	6	1712	1717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166362744
45	NC_010296	TTA	2	6	1719	1724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166362744
46	NC_010296	AAAG	2	8	1743	1750	75 %	0 %	25 %	0 %	166362744
47	NC_010296	TAA	2	6	1880	1885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166362744
48	NC_010296	ACG	2	6	1889	1894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166362744
49	NC_010296	TTA	2	6	1979	1984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010296	ACT	2	6	2047	2052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166362745
51	NC_010296	TCCCTC	2	12	2083	2094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166362745
52	NC_010296	TAAAAT	2	12	2100	2111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166362745
53	NC_010296	TAGA	2	8	2123	2130	50 %	25 %	25 %	0 %	166362745
54	NC_010296	GAA	2	6	2206	2211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166362745
55	NC_010296	CGC	2	6	2301	2306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	166362745
56	NC_010296	GGA	2	6	2379	2384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166362745
57	NC_010296	ATG	2	6	2447	2452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166362745
58	NC_010296	GCT	2	6	2521	2526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166362745
59	NC_010296	GCA	2	6	2607	2612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166362745
60	NC_010296	AGA	2	6	2826	2831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166362745
61	NC_010296	GAT	2	6	2896	2901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166362745
62	NC_010296	TCG	2	6	2912	2917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166362745
63	NC_010296	GGC	2	6	2941	2946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	166362745
64	NC_010296	TAAA	2	8	3092	3099	75 %	25 %	0 %	0 %	166362745
65	NC_010296	GAT	2	6	3100	3105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166362745
66	NC_010296	TTA	2	6	3190	3195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166362745
67	NC_010296	TGC	2	6	3263	3268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166362745
68	NC_010296	TTA	2	6	3322	3327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166362745
69	NC_010296	GCT	2	6	3355	3360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166362745
70	NC_010296	TCGAG	2	10	3488	3497	20 %	20 %	40 %	20 %	166362745
71	NC_010296	CAA	2	6	3505	3510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166362745
72	NC_010296	GTG	2	6	3565	3570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166362745
73	NC_010296	CTG	2	6	3595	3600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166362745
74	NC_010296	T	6	6	3698	3703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010296	ATA	2	6	3763	3768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166362746
76	NC_010296	GAC	2	6	3776	3781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166362746
77	NC_010296	ACG	2	6	3794	3799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166362746
78	NC_010296	ATA	2	6	3836	3841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166362746
79	NC_010296	ACAA	2	8	3875	3882	75 %	0 %	0 %	25 %	166362746
80	NC_010296	GGA	2	6	3936	3941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166362746
81	NC_010296	TC	3	6	4032	4037	0 %	50 %	0 %	50 %	166362746
82	NC_010296	TTG	2	6	4109	4114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166362746
83	NC_010296	TGAG	2	8	4261	4268	25 %	25 %	50 %	0 %	166362747
84	NC_010296	A	6	6	4272	4277	100 %	0 %	0 %	0 %	166362747
85	NC_010296	CAG	2	6	4292	4297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166362747
86	NC_010296	GTC	2	6	4354	4359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166362747
87	NC_010296	CTT	2	6	4536	4541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166362748
88	NC_010296	TTAAG	2	10	4546	4555	40 %	40 %	20 %	0 %	166362748
89	NC_010296	GGC	2	6	4584	4589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	166362748
90	NC_010296	CGG	2	6	4645	4650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	166362748
91	NC_010296	TGT	2	6	4677	4682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166362748
92	NC_010296	T	6	6	4759	4764	0 %	100 %	0 %	0 %	166362748
93	NC_010296	GCCAGA	2	12	4800	4811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166362748
94	NC_010296	CGG	2	6	4870	4875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	166362748
95	NC_010296	CAT	2	6	4930	4935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166362748
96	NC_010296	TAT	2	6	4957	4962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166362748
97	NC_010296	CTT	2	6	4975	4980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166362748
98	NC_010296	GACT	2	8	5095	5102	25 %	25 %	25 %	25 %	166362748
99	NC_010296	CGG	2	6	5128	5133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	166362748
100	NC_010296	TTC	2	6	5249	5254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166362748
101	NC_010296	A	6	6	5297	5302	100 %	0 %	0 %	0 %	166362748
102	NC_010296	AG	4	8	5611	5618	50 %	0 %	50 %	0 %	166362749
103	NC_010296	CCA	2	6	5683	5688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	166362749
104	NC_010296	GCC	2	6	5708	5713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	166362749
105	NC_010296	CCT	2	6	5741	5746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166362749
106	NC_010296	T	6	6	5773	5778	0 %	100 %	0 %	0 %	166362749
107	NC_010296	CTT	2	6	5848	5853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166362749
108	NC_010296	TGG	2	6	5857	5862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166362749
109	NC_010296	GCT	2	6	5904	5909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166362749
110	NC_010296	ATA	2	6	5930	5935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010296	CTTT	2	8	6012	6019	0 %	75 %	0 %	25 %	166362750
112	NC_010296	CTT	2	6	6064	6069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166362750
113	NC_010296	GAG	2	6	6070	6075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166362750
114	NC_010296	CGG	2	6	6094	6099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	166362750
115	NC_010296	ATAA	2	8	6157	6164	75 %	25 %	0 %	0 %	166362750
116	NC_010296	AAT	2	6	6250	6255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166362750
117	NC_010296	A	7	7	6416	6422	100 %	0 %	0 %	0 %	166362750
118	NC_010296	T	7	7	6443	6449	0 %	100 %	0 %	0 %	166362750
119	NC_010296	GTT	2	6	6451	6456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166362750
120	NC_010296	GTA	2	6	6464	6469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166362750
121	NC_010296	GTA	2	6	6491	6496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166362750
122	NC_010296	CTC	2	6	6501	6506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166362750
123	NC_010296	ATA	2	6	6514	6519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166362750
124	NC_010296	ATG	2	6	6540	6545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166362750
125	NC_010296	TCA	2	6	6582	6587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166362750
126	NC_010296	GATT	2	8	6664	6671	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010296	ACT	2	6	6689	6694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_010296	AAC	2	6	6826	6831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_010296	TAG	2	6	6864	6869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166362751
130	NC_010296	A	6	6	6935	6940	100 %	0 %	0 %	0 %	166362751
131	NC_010296	CAAG	2	8	6977	6984	50 %	0 %	25 %	25 %	166362751
132	NC_010296	CGC	2	6	6991	6996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	166362751
133	NC_010296	AGT	2	6	7060	7065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166362751
134	NC_010296	C	6	6	7114	7119	0 %	0 %	0 %	100 %	166362751
135	NC_010296	GAC	2	6	7131	7136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166362751
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137	NC_010296	TAC	2	6	7273	7278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166362751
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269	NC_010296	TGG	2	6	14564	14569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166362761
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